ליחידת ״ארז״ נבחרים מידי שנה טובי המפקדים מכל יחידות היבשה, וזאת מתוך כוונה שהם ישמשו עבור החניכים כמודל, דוגמא ומופת.

החל משלבי המיון, במהלך כל תקופת ההכשרה ועד לסיום שירותם הצבאי - תוכנית ״ארז״ תהווה עבור החניכים והבוגרים כבית שני (בנוסף על היחידות שבהם ישרתו), ומסיבה זו הוקמה לתוכנית, בנוסף על היחידה הצבאית, גם מנהלת ייעודית צבאית-אזרחית, שתפקידה לעקוב, ללוות ולפתח את החניכים לאורך השנים.

המנהלת מורכבת ממפקדים מנוסים וממומחי תוכן קבועים, שמסייעים ליחידה הצבאית במתן מענה למרכיבים הרבים והייחודים הכלולים בתוכנית.